Servei integral de seqüenciació de fins a 120 mostres fecals murines,mitjançant l’aplicació combinada, sobre cadascuna de les mostres, de les tècniques de seqüenciació metagenòmica i de seqüenciació d’amplicons del gen 16S, ambdues mitjançant tecnologia de seqüenciació Illumina. El nombre de 120 mostres té caràcter màxim estimat i no comporta l’obligació d’exhaurir-lo. Únicament es facturaran les mostres efectivament processades, d’acord amb el preu unitari ofert. El servei comprendrà l’organització de la recollida i del transport de les mostres (en una unica remesa), l’extracció de l’ADN a partir del material fecal, la preparació de les llibreries, la realització de les dues modalitats de seqüenciació, els controls de qualitat corresponents i el lliurament, en format digital, de les dades brutes obtingudes i dels resultats dels controls de qualitat. La seqüenciació metagenòmica haurà d’assolir una profunditat aproximada de 7,5 Gbp per mostra després del control de qualitat. La seqüenciació d’amplicons del gen 16S haurà d’assolir una cobertura mínima de 30.000 parells de lectures per mostra i s’haurà de realitzar en modalitat paired-end 2 × 250 bp. L’exigència de lectures paired-end 2 × 250 bp s’aplica exclusivament a la seqüenciació d’amplicons del gen 16S. No s’inclouen en l’objecte del contracte l’anàlisi bioinformàtica ni la interpretació científica dels resultats. Totes les actuacions descrites, inclosos la recollida i el transport de les mostres i l’extracció de l’ADN, hauran d’estar incloses en el preu unitari ofert, sense que es puguin facturar separadament despeses addicionals per aquests conceptes.

Fundació Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques · Cataluña